首个染色体级别山苍子基因组图谱构建成功

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2020-04-09 09:10

  7日,记者从中国林业科学研究院获悉,该院日前在《自然·通讯》杂志在线发表重要成果:成功构建全球首个染色体级别的高质量山苍子基因组图谱,并基于此揭示樟科物种进化及其精油合成的分子机制。

  山苍子是我国南方家喻户晓的一种香树。2016年10月,中国林业科学研究院亚林所研究团队启动了山苍子基因组测序项目,经过3年多努力完成项目,获得了大小为1.37G、片段重叠群N50为607.34Kb的基因组。通过Hi-C技术,他们进一步将基因组锚定到24条染色体上,锚定率94.56%,获得质量优良的山苍子基因组图谱。

  中国科学院院士、中国水稻研究所研究员钱前评价:“目前,对樟科植物果实精油及精油主要成分单萜化合物的生物合成机理尚不清楚,制约了樟科植物精准育种。林科院汪阳东团队选择樟科果实精油含量最丰富的物种——山苍子为研究对象,构建了山苍子全基因组图谱,并结合樟科20属47代表种低盖度基因组测序数据和16属23代表种混合组织及花苞转录组测序数据,揭示了单萜合酶基因家族在樟科中的演化,有效促进了樟科植物单萜化合物多样性和特异性,对揭示樟科植物的生物学特性、指导樟科遗传育种研究特别是加速分子育种进程具有指导作用。”

  据悉,中国林科院亚林所副研究员陈益存、博士赵耘霄、助理研究员高暝,比利时根特大学博士后李臻,华南农业大学博士王洁雨,清华大学博士刘可为是论文共同第一作者;中国林科院亚林所研究员汪阳东、台湾成功大学教授蔡文杰、福建农林大学教授刘仲健、根特大学教授Yves为共同通讯作者。

(责编:赵超、吕骞)

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